Distribución de virus de influenza aviar según vigilancia ambiental durante 2014-2018, China | Enfermedades infecciosas de la pobreza

Distribuciones geográficas de los virus de la influenza aviar

Según la RT-PCR, la tasa de positividad para influenza A fue del 22,57% (figura 1a). Las tasas de positividad fueron particularmente altas (25,96% – 45,51%) en 11 provincias en cinco de las siete regiones evaluadas: China central (provincias de Hunan), este de China (provincias de Fujian, Jiangxi y Zhejiang), sur de China (región autónoma de Guangxi), suroeste China (municipio de Chongqing, provincia de Guizhou) y noroeste de China (provincia de Gansu).

Entre los virus de influenza A detectados, el subtipo H5 se detectó en el 3.89% de las muestras (Figura 1b). Las tasas positivas fueron significativamente altas (11,42% – 13,79%) en dos provincias y un municipio en dos regiones: suroeste de China (municipio de Chongqing) y China central (provincias de Hunan y Jiangxi).

La tasa de positividad para el subtipo H7 fue de 3,41% (Figura 1c), con tasas de hasta 4% detectadas en dos regiones: el este de China (provincias de Jiangsu, Fujian, Zhejiang y Jiangxi) y China central (provincia de Hunan).

La tasa de positividad para el subtipo H9 es 13.07% (Figura 1d), con 11 PAM mostrando tasas positivas altas (13.07% – 27.07%). Estas regiones incluían el sur de China (provincia de Guangdong y la región autónoma de Guangxi), el este de China (provincias de Zhejiang, Anhui, Jiangxi y Fujian), China central (provincia de Hunan), el suroeste de China (provincia de Yunnan y municipio de Chongqing) y el noroeste de China (provincia de Gansu). y Región Autónoma de Xinjiang). Las tasas de positividad de ADN para los subtipos de influenza A, H5, H7 y H9 en diferentes regiones se muestran en la Figura 1 y en el Archivo complementario 1: Tabla S2.

Estacionalidad de los virus de la influenza aviar en el medio ambiente

Las tasas mensuales de positividad de ADN para los subtipos de influenza A, H5, H7 y H9 en muestras ambientales de aves de corral se muestran en la Fig. 2 y en el Archivo complementario 1: Tabla S3. Las tasas positivas de los subtipos de influenza A, H5, H7 y H9 mostraron una clara estacionalidad, más alta en diciembre y enero y más baja de mayo a septiembre.

Tasas mensuales de positividad de ADN para los subtipos de influenza A, H5, H7 y H9. La línea azul representa la tasa de positividad del ADN de la influenza A; La línea roja representa la tasa de positividad de ADN para el subtipo H5; La raya verde claro representa la tasa de positividad de ADN para el subtipo H7; La línea violeta representa la tasa de positividad de ADN para el subtipo H9

Diferencias en las tasas de positividad para los subtipos de influenza A, H5, H7 y H9 entre los sitios de muestreo

Durante el período 2014-2018, las muestras con las tasas positivas más altas para influenza A, H5, H7 y H9 se recolectaron de LPM (30,42%, 5,59%, 4,26%, 17,78%), seguidas de los mataderos (22,96%, 4,2%, 2,08%), 12,63%), respectivamente. Por el contrario, las granjas avícolas, los patios traseros y los hábitats de aves silvestres registraron tasas positivas de influenza A de 3,26%, 3,44% y 1,1%, respectivamente, mientras que las tasas positivas de H5 y H7 fueron inferiores al 1%. Las granjas avícolas, los patios traseros y los hábitats de aves silvestres tuvieron tasas positivas de H9 de 1,98%, 1,42%, 0,25%. El análisis estadístico indicó que los LPM y los mataderos se asociaron con tasas positivas significativamente más altas de AIV que todos los demás sitios durante el período de estudio (s<0,05; Tabla 1).

Diferencias en las tasas de positividad para los subtipos de influenza A, H5, H7 y H9 entre los diferentes tipos de muestras

Las muestras ambientales recolectadas de aguas residuales y tablas de cortar tuvieron tasas significativamente más altas de positivo para influenza A (36.58% y 33.1%), H5 (10.22% y 7.29%), H7 (4.24% y 5.69%) y H9 (21.62% y 18.75) . %) De los recogidos en heces, jaulas y comederos (s<0,05). Además, las tasas de positividad de H9 en las muestras de aguas residuales y tablas de cortar fueron significativamente más altas que las de los subtipos H5 y H7 (s<0,05; Tabla 2).

Se han detectado múltiples subtipos de virus de influenza A en entornos relacionados con las aves de corral

En total, se han aislado nueve subtipos HA y siete subtipos NA de virus de la influenza aviar, incluidos los subtipos HA H1, H3, H4, H5, H6, H7, H9, H10, H11 y subtipos NA N1, N2 y N3. Y N6, N7 , N8 y N9. En general, los subtipos H5, H7 y H9 del virus de la influenza A constituyeron la mayoría de los virus de la influenza aviar aislados de muestras ambientales (Archivo complementario 1: Tabla S4). La proporción de virus de la influenza aviar H9N2 fue del 46,90% entre todas las subespecies. Los AIV de H5N6 y H5N1 fueron 20,66% y 6,31%. La proporción de AIV H7N9 fue del 8,9%. La proporción de otras subespecies fue inferior al 0,5% excepto para H3N2 (6,15%), H6N6 (4,43%) y subtipos combinados (1,58%). Los AIV H9N2, H5N6 y H7N9 mostraron proporciones claramente diferentes de 2014 a 2018. La proporción de subtipo de AIV H5N6 aumentó más de tres veces, del 11% en 2014 al 34% en 2016, y luego disminuyó al 12,14% en 2017. El tendencia a la baja de 2014 a 2018. La proporción de AIV H7N9 fue del 23% en 2017, casi cuatro veces más que en 2014 (6%) y disminuyó a 0,26% en 2018. La proporción de AIV H9N2 mostró una disminución con respecto a 2014 a 2017, con proporciones de 59%, 51%, 35% y 36%, respectivamente, y luego aumentó a 53,36% en 2018 (Figura 3, Archivo complementario 1: Tabla S4).

Linaje de los virus AIV H5N1, H5N6, H7N9, H9N2 y otros subtipos de virus durante 2014-2018. El eje X representa diferentes años y el eje Y representa la proporción de diferentes subtipos de AIV (%). La relación se define como el número de diferentes subtipos de VIH / número total de virus (%). Abreviaturas AIV: virus de la influenza aviar