Duración de la eliminación de una variante de Omicron aislada de muestras de las vías respiratorias superiores recogidas de pacientes con casos notificados en Japón

En un estudio reciente publicado en enfermedades infecciosas emergentesEn este estudio, los investigadores realizaron un análisis retrospectivo para evaluar la duración de la propagación del síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2) omicron. Examinaron muestras clínicas recolectadas del tracto respiratorio superior de casos de pacientes con la variante Omicron en Japón.

antecedentes

La variante SARS-CoV-2 Omicron, debido a su alta tasa de infección y transmisibilidad, se ha extendido rápidamente por todo el mundo. Pocos estudios han informado sobre el curso clínico y la duración de la eliminación del virus en pacientes infectados con omicron en función de los valores del ciclo cuantitativo (Cq). Sin embargo, se desconoce la relación entre la duración de la eliminación del virus y la infección por la variante Omicron.

Para llenar este vacío, este estudio fue diseñado para evaluar los criterios para el aislamiento de pacientes infectados con SARS-CoV-2 infectados con la variante Omicron.

diseño del estudio

En este estudio, los autores incluyeron muestras clínicas residuales recolectadas de pacientes infectados con el virus SARS-CoV-2 Omicron en Japón entre el 29 de noviembre.^yY 2021 y 18 de diciembre^y2021. La variante Omicron se secuenció mediante la secuenciación del genoma completo y las secuencias obtenidas se cargaron en la Iniciativa mundial sobre el intercambio de todos los datos sobre la influenza (GISAID).

Las muestras de saliva o nasofaringe recolectadas de casos de coronavirus 2019 (COVID-19) en cuarentena en el aeropuerto fueron transferidas al Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (NIID) para la confirmación de la infección por la variante Omicron. La reacción en cadena de la polimerasa de transcripción inversa cuantitativa (qRT-PCR) midió el ácido ribonucleico (ARN) del SARS-CoV-2 y también se usó para analizar el aislamiento del virus. Se midieron los valores de Cq que representan los niveles de ARN viral.

Para evaluar la propagación del virus infeccioso, los autores clasificaron las muestras según la fecha de diagnóstico, la fecha de aparición de los síntomas y la fecha de resolución de los síntomas. 18 pacientes con la condición estudiada fueron vacunados con SARS-CoV-2, al menos 14 días antes del diagnóstico de COVID-19. De los 18 pacientes, 15 eran asintomáticos y tres eran asintomáticos.

los resultados

Los resultados de este estudio mostraron que entre las 101 muestras analizadas, se detectó un virus infeccioso en más del 9% de los infectados por SARS-CoV-2 Omicron (total 10; ocho pacientes asintomáticos y dos asintomáticos). Los niveles de ARN de SAR-CoV-2 fueron significativamente más altos en muestras nasofaríngeas y de saliva con virus infeccioso que en muestras sin virus infeccioso. Más del 41 % de los aislamientos virales se detectaron en muestras recolectadas de dos a cinco días después del diagnóstico. Sin embargo, no se detectaron aislamientos virales diez días después del diagnóstico de COVID-19.

Los autores señalan que las muestras del 20% al 30% de los pacientes con COVID-19 que desarrollaron síntomas del coronavirus. El virus infeccioso se detectó antes de que aparecieran los síntomas en los pacientes durante nueve días después del inicio de los síntomas, pero no se detectó diez días después del inicio de los síntomas. Se detectó excreción viral infecciosa en el 30% de los pacientes hasta 2 días después de que los síntomas desaparecieron, pero no se detectó propagación del virus tres días después de la resolución de los síntomas.

Conclusión

Los resultados del estudio muestran que los pacientes con COVID-19 completamente vacunados con la variante omicron del SARS-CoV-2 leve o asintomático se ven afectados por el virus infeccioso en muestras durante seis a nueve días después del diagnóstico y hasta que los síntomas se resuelven, pero no eso. El virus infeccioso se excreta diez días después del inicio de los síntomas. Esto sugiere que puede haber diferencias en la cinética de replicación del virus.

Sin embargo, el estudio tiene limitaciones porque el virus infeccioso se caracterizó mediante ensayos en solo 18 pacientes y se desconocía la infección fuera del estudio. No se dispuso de datos epidemiológicos sobre infecciones secundarias que ocurrieron en pacientes con virus infecciosos.

Además, los resultados del ensayo para el aislamiento y la infección del virus dependen del procedimiento de recolección de la muestra, las condiciones de almacenamiento y la duración. Por lo tanto, los informes negativos de las pruebas no garantizan que no haya virus infeccioso en la muestra. Finalmente, para algunos casos de pacientes cuyas muestras fueron saliva y cuyas muestras se recolectaron en la cuarentena del aeropuerto, la calidad de la muestra no fue adecuada para el aislamiento del virus.

Con base en los resultados de este estudio, el estado del brote de COVID-19 y los criterios de aislamiento en otros países, el 6 de enero de 2022 se cambiaron los criterios para el aislamiento de pacientes infectados con SARS-CoV-2 Omicron en Japón. Pacientes vacunados ya no se necesitan dos veces para obtener dos resultados consecutivos Para dar negativo en la prueba de COVID-19 diez días después de haber sido diagnosticado con COVID-19 o mostrar síntomas.