Estimación del período infeccioso del SARS-CoV-2

El principal agente causante de la enfermedad persistente por coronavirus 2019 (COVID-19) es el síndrome respiratorio agudo severo coronavirus-2 (SARS-CoV-2). Los científicos afirman que es necesario conocer los principales factores epidemiológicos de este virus para poder formular estrategias para mitigar su propagación.

Stady: Perfil no diluido de la infección por COVID-19. Crédito de la imagen: Katrina Kon

antecedentes

El principal parámetro epidemiológico que determina la tasa de transmisión del virus es el período obstétrico, es decir, el período entre la infección del infeccioso (el primer caso) y el infeccioso (el caso secundario). Es difícil inferir los períodos obstétricos porque confirmar el momento exacto de la infección no es una tarea fácil.

En este contexto, para determinar el intervalo de tiempo para la generación de una enfermedad infecciosa emergente, los investigadores generalmente se basan en el período de incubación (el tiempo entre la infección con el virus y el inicio de los síntomas) y el intervalo de serie (el tiempo entre el inicio de síntomas de infección e infección).

Estudios anteriores revelaron que estos factores epidemiológicos varían según el hospedador y las condiciones de transmisión. Es por eso que los parámetros epidemiológicos se describen como distribuciones en lugar de valores fijos.

En general, en el caso de una pandemia en curso, la tasa de transmisión o si la propagación del virus está controlada se determina mediante el estudio de la distribución intergeneracional. A nivel poblacional, el período obstétrico se distingue por el número de reproducción (R) del virus.

Los cortos períodos de generación causados ​​por la transmisión de COVID-19 antes de que aparezcan los síntomas desafían la efectividad de varias estrategias de mitigación, como la cuarentena, el rastreo de contactos y las pruebas.

Como se mencionó anteriormente, las distribuciones de intervalo de generación y de intervalo de serie pueden cambiar de acuerdo con el comportamiento de la población. Por ejemplo, seguir varias estrategias no farmacológicas, como el distanciamiento social y el aislamiento, evita una mayor transmisión del virus.

Nuevo estudio

Un nuevo estudio publicado en medRxiv* Servidor de preimpresión, enfocado a estimar la dinámica temporal de transmisión de casos infectados en ausencia de medidas de intervención (período obstétrico no diluido). Esta estimación es muy importante porque refleja la efectividad de las políticas de mitigación en ausencia de otras intervenciones. Sin embargo, tal estimación es una tarea desafiante porque los individuos sintomáticos pueden aislarse a sí mismos y prevenir la transmisión.

Los autores abordaron este problema aplicando un estricto procedimiento de procesamiento de datos, es decir, consideraron los eventos de transmisión que ocurrieron antes de que se implementaran las medidas de mitigación clave y antes de que se generalizara el conocimiento del COVID-19. Hasta ahora, los investigadores no han tenido en cuenta factores, como el rastreo de contactos y el aislamiento de casos, para estimar la distribución intergeneracional.

En este estudio, los científicos midieron las distribuciones de los intervalos de generación y el período de incubación al observar todos los intervalos de secuencia en el conjunto de datos del par de transmisión. Se encuentran disponibles varios estudios que evalúan el período obstétrico, pero algunos problemas metodológicos importantes pueden llevar a resultados significativamente sesgados en dichos estudios.

En este estudio, los investigadores combinaron todos los datos de transmisión disponibles asociados con el brote inicial de COVID-19 cuando las políticas de mitigación eran mínimas y pudieron agrupar datos de pares de transmisión de 12 conjuntos de datos. A continuación, realizaron estudios estadísticos para inferir las principales fuentes de sesgo en la estimación de la distribución intergeneracional.

los resultados

Los investigadores encontraron que los efectos de los pasos de mitigación y el comportamiento impulsado por la conciencia afectaron significativamente la transmisión de COVID-19 en la etapa tardía de la infección. No incluir estas fuentes subestimó la distribución intergeneracional.

Los científicos revelaron que las estrategias de mitigación redujeron la cantidad de transmisión post-sintomática y aumentaron la transmisión presintomática. Estos resultados se validaron mediante el inicio sintomático de la transmisión (TOST).

El estudio actual informó una mediana del período obstétrico de 7,9 días y una mediana de 9,7 días, lo que significa que el período de inicio es mucho más largo de lo que se suponía anteriormente.

determinantes

Una limitación importante de este estudio es que los conjuntos de datos utilizados para el análisis se obtuvieron de estudios publicados anteriormente.

Además, los datos de los pares de transmisión tienden a ser inadecuados para determinar la dirección de la transmisión, especialmente cuando la transmisión presintomática causa síntomas posteriores a la infección, lo que dificulta determinar quién infectó a quién.

Los autores abordaron estos sesgos con un enfoque de suavizado, en el que se omiten algunos puntos de datos en cada muestra introductoria.

Además, se realizaron análisis de sensibilidad para abordar algunos sesgos importantes, por ejemplo, la evaluación del período asociado con la transmisión no diluida, la consideración de períodos secuenciales largos en el conjunto de datos, etc.

Estos análisis revelaron que, aunque los sesgos podrían subestimar la distribución del intervalo generacional inferido, las conclusiones preliminares con respecto a los períodos generacionales largos y no diluidos se mantuvieron firmes.

conclusión

Los científicos afirmaron que las estimaciones del estudio actual podrían ayudar a formular una política de cuarentena. Este estudio indica que las personas liberadas de la cuarentena el día 14 aún pueden transmitir el SARS-CoV-2.

En el futuro, la metodología desarrollada en este estudio podría ayudar a estimar el intervalo de generación de variantes emergentes del SARS-CoV-2 que muestran una dinámica de transmisión alterada.

*Nota IMPORTANTE

medRxiv publica informes científicos preliminares que no han sido revisados ​​por pares y, por lo tanto, no deben considerarse concluyentes, guiar la práctica clínica / comportamiento relacionado con la salud o tratarse como información establecida.