La carrera está en marcha para localizar la nueva variante COVID-19

Los pasajeros desembarcan brevemente del crucero MSC Europa después de atracar en aguas sudafricanas, mientras se propaga el nuevo coronavirus Omicron, en Ciudad del Cabo, Sudáfrica, el 30 de noviembre de 2021.

LONDRES / BRUSELAS / SINGAPUR (Reuters) – Los gobiernos de todo el mundo están buscando urgentemente en bases de datos casos recientes de COVID-19, examinando a los viajeros y decodificando los genomas virales de la nueva variante mientras intentan medir su propagación. .

El ritmo de trabajo destaca la presión sobre los gobiernos y las autoridades de salud pública para que decidan rápidamente si deben tomar medidas impopulares y económicamente dañinas para limitar la propagación de Omicron.

Los datos muestran que estaba en circulación antes de que fuera identificado oficialmente en Sudáfrica la semana pasada y desde entonces ha sido descubierto en más de una docena de países Leer más. Se necesitarán semanas para determinar si las vacunas son más contagiosas, letales o eludidas.

Gran Bretaña y otras economías importantes prohibieron los vuelos hacia y desde Sudáfrica pocos días después de que se descubrió la alternativa, lo que alarmó a los mercados financieros mundiales y generó preocupaciones sobre el daño económico.

La velocidad de la acción contrasta marcadamente con la aparición de otras variantes: cuando las primeras muestras de la variante alfa se documentaron en Gran Bretaña en septiembre de 2020, el gobierno pasó meses recopilando datos y evaluando el riesgo potencial antes de imponer un bloqueo a nivel nacional en diciembre.

La Organización Mundial de la Salud (OMS) tardó meses en designarlo como un tipo diferente de preocupación: su nivel más alto.

Poco después de que se revelara el primer caso de Omicron el viernes, Israel anunció que compraría 10 millones de kits de PCR adicionales que pueden detectar la variante en un esfuerzo por contener su propagación. Cerró sus fronteras a los extranjeros de todos los países el sábado.

Escocia y Singapur se apresuran a comprobar decenas de miles de casos positivos recientes en busca de signos de una variante que pueden haber pasado por alto y Estados Unidos fortalecer Monitoreo de COVID-19 para distinguir los casos locales de la variante Omicron del delta aún dominante.

El comisionado de salud de la Unión Europea instó a los estados miembros a intensificar los esfuerzos para detectar mutaciones, ya que algunos todavía están atrasados ​​casi dos años en la pandemia. Lee mas

El bloque ha confirmado hasta ahora 42 casos en 10 países.

«Algunos estados miembros están muy atrasados ​​en esta dimensión crítica», dijo Stella Kyriakides en una carta vista por Reuters a los ministros de salud de 27 países de la UE.

«Ya nos enfrentamos a un invierno difícil debido a la alta susceptibilidad a la transmisión de la variante delta (…) ahora podemos experimentar tensiones adicionales o adicionales debido a la aparición de la variante Omicron», escribió.

TODO SOBRE S-GENE

La mayoría de las pruebas de PCR no pueden distinguir OMICRON de la variante delta, la versión dominante y más contagiosa del virus hasta la fecha.

Para distinguir Omicron de Delta, la prueba de PCR debe poder identificar una mutación en Omicron conocida como fuga del gen S o falla del objetivo del gen S (SGTF).

No es seguro porque la variante alfa, identificada por primera vez en Gran Bretaña, también contiene esta mutación.

Dado que el alfa ya no está muy extendido, la presencia de la fuga del gen S indica que la muestra es Omicron-positiva y alerta al laboratorio para que envíe la muestra para la secuenciación del genoma para su confirmación.

Si las pruebas de PCR locales no pueden identificar esta mutación, las muestras de hisopo de PCR seleccionadas al azar deben someterse a la secuenciación del genoma, que puede tardar hasta una semana.

La Organización Mundial de la Salud dijo que las pruebas ampliamente disponibles pueden detectar individuos infectados con cualquier variante, incluido Omicron.

Sin embargo, hasta ahora solo ha recomendado la prueba TaqPath producida por la empresa estadounidense Thermo Fisher (TMO.N) como agente.

No está claro si los países comprarán kits debido a la característica única de la prueba. Kenneth Mack, director de servicios médicos del Ministerio de Salud, dijo a Reuters que Singapur estaba considerando comprar más, aunque no se había tomado ninguna decisión. Lee mas

Thermo Fisher dijo que está listo para aumentar la producción para satisfacer la demanda de países de África y otros lugares mientras trabaja para rastrear la propagación de la nueva variante.

Un día después de identificar la alternativa, Israel comenzó a verificar la presencia del gen S en todas las pruebas positivas tomadas a los viajeros que llegaban al aeropuerto principal Ben Gurion, dijo al Parlamento la jefa de salud pública de Israel en el Ministerio de Salud, Sharon Alroy-Press. el domingo.

El Departamento de Salud dijo que sus laboratorios ahora están monitoreando esta mutación en todas las pruebas en todo el país y cuando una prueba de PCR positiva indica SGTF, la muestra se toma para una posterior secuenciación.

La mayoría de los laboratorios de EE. UU. Utilizarán la prueba TaqPath, dijo a Reuters Scott Baker, director ejecutivo de la Asociación de Laboratorios de Salud Pública (APHL), una red de laboratorios de salud pública estatales y municipales.

Peculiaridades alternativas

De las 150.000 pruebas positivas que se remontan a un mes evaluadas en Bélgica, 47 fueron casos de fuga del gen S y alta carga viral. Solo uno de ellos fue Omicron, según Mark van Rast, uno de los virólogos que analizó las muestras.

Las autoridades escocesas llevaron a cabo difamaciones que se remontan al 1 de noviembre para ayudar a descubrir nueve casos de Omicron, todos relacionados con el mismo evento. Lee mas

Descubrieron que alrededor del 16 de noviembre, la falla del objetivo del gen S comenzó a aparecer en las pruebas nuevamente, una semana antes de que Sudáfrica y Botswana identificaran la nueva variante. Esta característica ayudó a guiar la secuenciación genética, como lo hizo cuando apareció Alpha.

«Esta es una de las peculiaridades de esta alternativa en particular que podemos utilizar para nuestro beneficio», dijo el lunes Gregor Smith, director médico de Escocia.

Eso significa que el gobierno puede comenzar a estimar la prevalencia de la nueva variante, dijo Smith, e identificar quién podría necesitar ser evaluado nuevamente y qué muestras deben priorizarse para una mayor decodificación en los laboratorios.

«Es la mejor manera en que deberíamos poder identificar casos en este momento».

(Información adicional de Alistair Smoot en Londres, Francesco Guaracchio en Bruselas, Chin Lin en Singapur, Julie Steenhuisen en Chicago y Mayan Lobel y Ari Rabinovich en Jerusalén. Editado por Nick McPhee

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