Los pacientes inmunocomprometidos presentan una infección a largo plazo con SARS-CoV-2 y mutaciones únicas

recién Microbio de lanceta El estudio explora la evolución dentro del huésped y los factores de riesgo asociados con la infección por coronavirus 2 (SARS-CoV-2) del síndrome respiratorio agudo severo a largo plazo en pacientes inmunocomprometidos.

Estancia: Eliminación y progresión del SARS-CoV-2 en pacientes inmunocomprometidos durante el período eumicrón: un análisis prospectivo multicéntrico. Crédito de la imagen: Saberwolf/Shutterstock.com

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Los pacientes inmunodeprimidos son más vulnerables a la infección por SARS-CoV-2, ya que es posible que no desarrollen suficiente inmunidad y estén menos protegidos por las vacunas. Investigaciones anteriores han demostrado que los pacientes inmunocomprometidos, especialmente aquellos diagnosticados con síndrome de deficiencia autoinmune (SIDA), tienen un mayor riesgo de infección prolongada; Sin embargo, la mayoría de estos estudios son retrospectivos y están sujetos a cierto grado de sesgo.

La propagación de nuevas variantes del SARS-CoV-2 está limitada principalmente por la dinámica estocástica de transmisión y la eliminación del huésped. Sin embargo, la replicación dentro del huésped en pacientes inmunocomprometidos puede proporcionar tiempo suficiente para que el virus adquiera mutaciones.

Los científicos plantearon la hipótesis de que las variantes preocupantes (VOC) del SARS-CoV-2, como las variantes Alpha (B.1.1.7) y Omicron (BA.1), surgieron durante infecciones prolongadas en personas inmunodeprimidas. Aún no está claro si las intervenciones actuales reducirán o facilitarán el desarrollo de variantes altamente mutadas en pacientes inmunocomprometidos.

Sobre el estudio

Para abordar preguntas urgentes sobre la infección por SARS-CoV-2 en personas inmunodeprimidas, los investigadores realizaron una vigilancia prospectiva en pacientes ambulatorios y hospitalizados diagnosticados con infección por SARS-CoV-2 Omicron. Este estudio prospectivo y multicéntrico inscribió a pacientes adultos de cinco centros médicos de Estados Unidos, todos ellos inmunocomprometidos y que habían dado positivo en la prueba de COVID-19 en los 14 días anteriores.

Se recogieron muestras nasales y se analizaron cada dos a cuatro semanas mediante un ensayo de reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa (RT-PCR) hasta que el resultado de la prueba fue negativo en muestras sucesivas. En las muestras positivas se realizaron cultivos virales y secuenciación del genoma completo.

Al analizar el cultivo viral, la carga viral de ARN y los datos de secuenciación, los investigadores identificaron a las personas que tenían mayor riesgo de infección prolongada, los efectos de los tratamientos antivirales y la dinámica evolutiva del SARS-CoV-2 en estas poblaciones vulnerables. población.

Resultados clave

La infección prolongada por SARS-CoV-2 fue poco común en este grupo diverso con inmunodepresión de moderada a grave. En una amplia gama de estados inmunocomprometidos, se ha observado una progresión relativamente limitada del SARS-CoV-2.

En las infecciones de corta y larga duración, la tasa de evolución dentro del huésped fue similar. La duración del período infeccioso en pacientes inmunocomprometidos es el principal factor diferenciador.

En pacientes infectados durante períodos prolongados, se han acumulado mutaciones en el dominio de unión al receptor viral (RBD). Además, se han observado varias variantes en las cepas de Omicron actuales o posteriores.

Las investigaciones sobre importantes factores de riesgo han revelado una disfunción o agotamiento de las células B, que puede ser causado por la terapia anti-CD20 o anti-CD19, mieloma o linfoma. Este hallazgo es consistente con informes de casos publicados anteriormente, donde se observó metástasis de células B en infecciones prolongadas, lo que destaca el papel fundamental de los anticuerpos en la eliminación del virus SARS-CoV-2.

Informes de casos anteriores han documentado una replicación viral prolongada en personas con infección por el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH). Esto es consistente con la experiencia de un paciente en el grupo de estudio con SIDA que tuvo un período de infección prolongado de >200 días. Este paciente tenía un recuento de CD4 inferior a 50 células/μl y mostraba una replicación incontrolada del VIH, lo que también podría atribuirse a una inmunidad humoral deteriorada.

Conclusiones

Algunas limitaciones notables del estudio actual incluyen el pequeño tamaño de la muestra con una muestra de seguimiento que dio positivo para SARS-CoV-2 mediante RT-PCR en tiempo real, lo que limitó el alcance del estudio de características relevantes para la evolución viral. Para mitigar el posible sesgo con respecto al estado inmunocomprometido, la definición se mantuvo deliberadamente amplia; Sin embargo, esto también llevó a la inclusión de personas con deterioros inmunológicos de leves a modestos que eran menos susceptibles a una infección prolongada.

Dado que aproximadamente el 75 % de los pacientes no tuvieron una muestra de seguimiento positiva, la repetición de la recolección de muestras entre 2 y 4 semanas puede considerarse muy rara. Otra limitación notable de este estudio es la falta de un grupo de control inmunocompetente. Además, el estudio actual sólo se realizó en los Estados Unidos, lo que limita la generalización de los hallazgos.

El estudio actual analizó a adultos inmunocomprometidos que dieron positivo en la prueba de SARS-CoV-2 y observó una duración más significativa de la infección y la progresión viral en pacientes con agotamiento de células B y malignidad. Las mutaciones en pacientes inmunocomprometidos no predijeron fuertemente las mutaciones ómicrones posteriores, lo que sugiere que podrían ser útiles enfoques alternativos basados ​​en la vigilancia genómica.